Описание
Готовые NGS панели для таргетного обогащения Share Designs были разработаны, как самой компанией Roche, так и в коллаборации с учеными из разных частей света. Портфолио панелей постоянно расширяется, в соответствие с возникающими потребностями в научных областях, таких как: онкология, генетика человека, сельское хозяйство и другие приложения.
Панель Метаболические заболевания человека / Human Metabolic Disease Methylome Design
- SeqCap Epi Developer XL Design: 131010_HG19_EG_met_EPI
- Организм: Homo sapiens (Человек)
- Сборка генома: GRCh37/hg19
- Файлы дизайна: McGill Disease Methylome
- Коллабораторы: Доктор Элин Грундберг, Университет Макгилла и Геномный Квебекский инновационный центр, кафедра генетики человека, Университет Макгилла, Монреаль, Квебек, Канада
- Спецификации/детали: · Панель охватывает 156Mb и покрывает ~4.5 миллиона уникальных CpGs ( ~9 миллионов всех CpGs) и ~3 миллиона аутосомных SNPs из dbSNP137, давая возможность исследователям производить одновременно эпигенетические исследования и GWAS исследования, фокусируясь на метаболических заболеваниях и соответствующих им особенностях.
Регионы, на которые нацелена панель, несут в себе функциональный метилом, включая:- CpGs, содержащиеся в низкометилированных и неметилированных регионах, обнаруженных в данных масштабного полногеномного бисульфитного секвенирования из жировой ткани человека и ассоциированных с энхансерами и промотерами, соотвественно
- Дополнительные CpGs, локализованные в регионах регуляторных элементов человеческих жировых клеток (H3K4me1 и H3K4me3 помеченных энхансеров и промотеров, соответственно), профилированных консорциумом NIH Roadmap Epigenomics Mapping Consortium.
- Все ~480 000 CpGs из 450K array Illumina
- Около 30 000 регионов, покрывающих GWAS локусы, ассоциированные с метаболическими заболеваниями, из NHGRI GWAS каталога (9 января, 2014)
- Около 250 000 высокоинформативных геномных тагов SNPs, обнаруженных в разнообразии популяций со всего мира из Illumina Human Core BeadChip.
- Информация для заказа:
Тип продукта: SeqCap Epi Developer XL
Название дизайна: 131010_HG19_EG_met_EPI
Внутренний референсный номер IRN #: 4000019550
Митохондриальный геном / Mitochondrial Genome Design
- SeqCap EZ Design: Mitochondrial Genome Design
- Организм: человек
- Сборка генома: HG38
- Файлы дизайна:
- Спецификации/детали: Это дизайн для захвата 16 Kb полного митохондриального генома.
- Публикации/информация:
- Информация для заказа:
Тип продукта: SeqCap EZ Share Developer
Название дизайна: 140910_GRCh38_chrM_v1_EZ
Внутренний референсный номер IRN #: 4000021490 - Каталожный номер:
24 реакции: 08333025001
96 реакций: 08333033001
384 реакции: 08333050001
Более подробно можно ознакомиться на сайте компании-производителя